Cell | 免疫系统疾病中免疫系统细胞特异基因调控动态全景图

京都大学的数据资料分析其他部门和RIKEN Research数据资料分析所的同事们并未建立了首个针对自身依赖性性性疾病和自身瘙痒性性疾病的蛋白质在线。努力这一人力能为依赖性性疾病的的发展提供者新的见解，并显然有助于用药的挖掘出有。研究团队们还努力，与依赖性之外的遗传物质数据资料图谱最终显然应用领域诸如COVID-19等传染病的数据资料分析。

京都大学项目数据资料分析经理，药理学风湿病学家，功用遗传物质学数据资料分析专家Mineto Ota博士问道：“要洞察性疾病，就必须深刻理解蛋白质变异的功用。有了这个数据资料集，我们就可以将与性疾病之外的DNA碱基波动的数据资料与对性疾病得病机制相对不可或缺的蛋白质和肝细胞多种类型关连性大大的。”Ota是该团队发表发表文章在《Cell》新闻周刊上的发表文章的主要作者，发表文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的研究团队们合作同步进行的。

作者谈到，依赖性抑制的性疾病（IMD）都有从自身依赖性性到自身瘙痒的多种病因。他们表明有，尽管IMD里面炎性肝细胞因子的精神状态活动表明病原体功用发生了波动，但是，“对于IMD的之外蛋白质甚至之外肝细胞多种类型知之甚少。”

正因如此遗传物质关连性数据资料分析（GWAS）挖掘出有了许多与IMD之外的遗传物质启动子。但是，在此类关连性数据资料分析里面鉴定出有的许多蛋白质变异都地处恒定蛋白质“on”或“off”传达的DNA非UTF-区域，而不是地处蛋白质UTF-碱基里面。数据资料分析小组表明有：“GWAS并未揭示了许多与多样性状和性疾病之外的遗传物质启动子，都有IMD。这些变异里面的大多数都地处非UTF-遗传物质区域，尤其是催化反应电子元件，如增强子和启动子。”

为了揭示催化反应DNA的功用，一种相异多种类型的遗传物质分析，称为传达定量性状蛋白质启动子（eQTL），旨在将DNA碱基的相异与蛋白质传达的相异关连性大大的。利用eQTL数据资料，数据资料分析其他部门可以对催化反应DNA碱基的目的、催化反应碱基里面的变异如何影响其催化反应蛋白质的传达以及这些蛋白质传达相异如何导致性疾病做出有更明智的传闻。

其它针对依赖性的eQTL数据资料分析并未在同步进行里面，但先前的科学数据资料分析只都有心理健康参与者，并检查了有限数量的肝细胞多种类型。数据资料分析其他部门谈到：“对心理健康NAD病原体的数据资料分析显然未能捕获性疾病稳定状态下挖掘出有的一系列eQTL振荡。此外，虽然对病原体的各种类型刺激可以在并不一定上实时性疾病稳定状态，但相当心里反映出有肝细胞的心理环境。”

Ota必需道：“瘙痒稳定状态下，病原体的物理特点与心理健康稳定状态下的不同肝细胞截然相异。与依赖性原因之外的蛋白质变异显然只在卧床稳定状态下起作用，因此对于这种多种类型的蛋白质数据资料分析，从想像症状身上获取样本相对不可或缺。”

在他们最新美联社的数据资料分析里面，数据资料分析小组对79名心理健康参与者和337名被诊断患有10种相异多种类型依赖性抑制性疾病（都有类风湿性关节炎、系统化心绞痛和系统化癌症）的症状同步进行了正因如此遗传物质测序。所有参与者都是欧美双重国籍。

洞察依赖性抑制的性疾病具有原创性，因为尽管每种性疾病在药理学上都是相异的，但仍有许多分开之处，并且具有不同诊断的症状则会表现出有相对相异的症状。数据资料分析其他部门必需问道：“由于所有这些丰富性，一次进修一种依赖性抑制性疾病的能力是有限的。但是，如果我们一起数据资料分析10种性疾病，就可以更正因如此面地洞察这些多种类型的性疾病。”

在进行时正因如此遗传物质测序后，数据资料分析其他部门从参与者的血液样本里面提炼有28种相异多种类型的依赖性之外肝细胞，并测量了这些肝细胞里面的蛋白质传达。“我们在图谱里面看到，每种病原体多种类型都有相异的eQTL结果，这可以告知我们肝细胞多种类型之间蛋白质催化反应的相异，以及哪种肝细胞多种类型对于的发展哪种性疾病至关不可或缺。”数据资料分析其他部门问道。

作者分析报告问道，“在蛋白质传达分析里面，我们在一个平台上对多个IMD同步进行相对，使我们能够描绘每个性疾病（症状）的外观上，并识别系统与单个性疾病依赖性之外的蛋白质，以及在举例来问道IMD里面心理因素的通路……我们的数据资料集使我们能够样品每个特定肝细胞多种类型里面eQTL振荡的心理（性疾病）历史背景涡轮的阻碍。”

数据资料分析其他部门将得到的人力命名为京都大学病原体蛋白质传达图谱（ImmuNexUT），并问道它亦然了用于东亚双重国籍参与者建立的最大的eQTL数据资料集。他们回顾道：“我们考虑到了病原体多种类型依赖性的eQTL振荡，都有基本上并未美联社的罕见肝细胞多种类型，它们在心理瘙痒条件下的丰富性，以及这些eQTL与IMD遗传之间的相当大关连性。”

“到现阶段，在这一领域，大规模的遗传物质和功用遗传物质数据资料分析主要是利用欧洲地区ACS同步进行的，尽管社会阶层丰富性对于精准理解遗传物质功用至关不可或缺。”数据资料分析其他部门问道，“这个欧美受试者的eQTL图谱对于解决这种以欧洲地区为里面心的偏见，结合欧洲地区的数据资料集进一步数据资料分析DNA变异的功用，也具有不可或缺涵义。”

数据资料分析其他部门努力ImmuNexUT在线将一直增长速度，并最终为症状促使更好的结果。他们问道：“与之前美联社的人力相比，我们的数据资料集具有独具而有利的特点，都有正因如此面的病原体区分、ACS之间依赖性原因的波动以及就其的非欧洲地区ACS。”