顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD扫描的应用前景!

2022-01-31 05:04:42 来源:
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"性状被划定MRD验证的发展前景是恰当的,希望这些进展将一直进一步提高下一代MRD验证的有效性。"

肝癌的MRD验证是一种灵敏且特异的用以监控肝癌病征血浆之中源性遗传物质(如ctDNA)相对数量的步骤。在这种状态下,病征没有昏暗可见的病灶,但确实依赖于标准诊疗幻灯片步骤无法验证到但事与愿违不会导致肝癌复发的均匀分布病灶。

MRD,常常称为均匀分布残余病灶(Minimal Residual Disease)。运用于“Minimal” (均匀分布)这个含义,是因为它在文献和诊疗专家之中愈来愈近似于。不过,“Minimal”这个含义显然不具“误导性”,因为起码的病变在病因和病人决断方面也显然不具重要意涵。“Measurable”(可测量)一含义可愈来愈有效地说明了残余在病人体内的癌细胞的依赖于。NCCN简介同时运用于了“Minimal Residual Disease”(均匀分布残余病灶)和“Measurable Residual Disease”(可测量残余病灶)两个术语。

此外,可行性学术研究表明在分子素质上验证多种肝癌特性的ctDNA同样不具诊疗效用,文献和诊疗专家有时也不会运用于“Molecular Residual Disease”(分子残余病灶)一含义。

近年来,国内外在虚拟之中基于ctDNA的MRD评量(ctDNA-MRD)的诊疗原始数据和确实更加多,开启了虚拟瘤MRD验证的热潮。虚拟瘤ctDNA-MRD验证的电子技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情分析方法)

对原发一个组织展开PCR以检验病征的特异遗传物质组变异图集,然后设计引物应用软件panel或运用于固定panel展开全方位的ctDNA验证分析方法。

2)Tumor-uninformed assays(发觉分析方法)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无需原发一个组织,相当常少依赖于除此以外预先选定引物/探针设计的与肝癌特性同样的固定panel展开ctDNA验证分析方法,常常在验证ctDNA性状的同时,辅以ctDNA性状或片段组兼修等多组兼修步骤。弥补了一个组织样本太少或监控残基太少或TAT过长等原因。

Tumor-informed assays的电子技术方针愈来愈符合大众的思维,在必需高基因表达的必要条件下,可通过监控多残基的sample-level(样本素质)促使进一步提高其清晰度,电子技术如此一来相对来说不是同样高。Tumor-uninformed assays的电子技术方针愈来愈在在早筛,通过进一步提高site-level(残基素质)验证清晰度并辅以ctDNA性状或片段组兼修并联结机器兼修习算法促使进一步提高其清晰度和基因表达,电子技术如此一来相对来说较高。

2021年4月29日,《Clinical Cancer Research》应用软件发表了“相当常少运用于尿液ctDNA验证结直肠癌病征均匀分布残余病灶(MRD)”的短文,首次公开了Guardant Reveal的学术研究原始数据:MRD验证清晰度远超91%,基因表达达100%,这些注意到赞成了相当常少尿液ctDNA-MRD验证(Tumor-uninformed assays)的潜在诊疗分析方法方法。

2021年8月13日,《Clinical Cancer Research》应用软件发表了“顺应潮流:相当常少尿液ctDNA-MRD验证的分析方法方法前景”的短文,在这里学术科学界们发表意见评量了相当常少尿液ctDNA验证MRD的战斗能力,以及将性状结合到ctDNA验证的潜在用处。2

Parikh及其上司1 和Taieb及其上司3 发表意见了相当常少尿液ctDNA-MRD验证在结直肠癌(CRC)病征之中的潜在诊疗分析方法方法。

▲ ctDNA性状和性状在两项学术研究之中的分析方法方法比较(Parikh和Taieb)

结直肠癌(CRC)的病人始终面临着一个挑战,即相当多的CRC病征因最初病症复发而早早死亡者。尽管诊疗引入了标准的专用病人,但高风险IIIC期CRC病征的5年生存率也相当常少有53%,究其原因是没有注意到幻灯片兼修上并未验证到的均匀分布残余病灶(MRD)。4

目前,仍迫切需有效具体哪些病征术后依赖于MRD,以帮助指导工作减少或进一步提高专用病人,并进一步提高治好的显然性,同时最大限度地减少不必要病人的同样毒性。

在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC临床和病因之中的分析方法方法有了为广泛的洞察。目前,基于ctDNA的MRD评量正为广泛用以肝癌的病人之中。

ctDNA是由DNA的微电影段组成(大约130-150bp),由癌细胞通过衰老、发炎或腺体特赦到呼吸系统之中。 ctDNA的氙较短致使其带进敏感的实时损耗标志物,它的依赖于显然反映了幻灯片兼修上只不过的微集中于。

在治好性病人就此结束后,ctDNA之中显露现的体细胞性状对随后的幻灯片兼修复发不具较高的阴性预期效用,同样是当这些性状与手术的一个组织之中的性状相匹配时。验证这种ctDNA并不一定的MRD可以在I-III期CRC之中提早幻灯片兼修数月预期复发,从而为除此以外事与愿违不会复发的CRC病征获取一个评量新疗法的窗口。然而,这些ctDNA体系性状并不一定的MRD验证步骤的清晰度始终是受限的,迫切需改进其验证有效性。

ctDNA的性状验证胜过ctDNA的体系性状验证。ctDNA的性状间歇性在CRC之中相当常常常见,并被视为大多数癌变的最初阶段。这种性状,具体并不一定为DNA之中核苷酸的C5位置添加烷基自由基,调节附近遗传物质的表达,包括经典的惟恐癌遗传物质失活。与体系性状相比,CRC之中依赖于愈来愈多的性状间歇性区域,为进一步提高MRD验证的清晰度获取了机不会。SEPT9,就是第一个运用血浆验证单遗传物质性状间歇性展开筛查和最初验证CRC的步骤。尽管ctDNA性状有这些优点,但这些不尽相同的特性也需谨慎,以保持一致验证分析方法的基因表达,并避免显露现;也阴性的显然性。

在这种背景下,Parikh和Taieb的总括最新学术研究结果为我们对ctDNA有效性的理解获取了有用的补充,即无需原发一个组织,相当常少通过血浆ctDNA性状或合组ctDNA性状即可展开有效的MRD评量。与其他需对原发一个组织展开PCR以指导工作后续ctDNA分析方法的验证不尽相同,总括学术研究探讨了Tumor-uninformed assays的有效性,它有几个优势,包括较慢的TAT,降低初始成本,对一个组织太少或不比如说的病征展开监控。

Parikh等人获取了一种ctDNA性状联结ctDNA体系性状的固定panel展开MRD的分析方法评量(NGS步骤),与其他商业上比如说的MRD验证步骤相比,这种步骤不需手术的一个组织以及应用软件既有。在事与愿违病人后运用于时,这种相当常少尿液ctDNA-MRD验证对复发不具诊疗意涵的基因表达(100%)和清晰度(55.6%),通过结合表观遗传物质组构造和纵向监控分析方法,其清晰度可促使进一步提高至91%。1 该步骤被用以正试图展开的创新性学术研究,包括指导工作IIA期结肠癌病人决断的NRG合作组学术研究(NCT04068103)。虽然还需额外的原始数据集来验证这些注意到,但这些结果显然了基于ctDNA的MRD验证在发觉的情况下可遵从的验证有效性构造。

Taieb等人的学术研究运用了一对原先被显然是CRC手术后病因同样的性状遗传物质标记物WIF1和NPY(ddPCR步骤),并将它们用以PRODIGE-GERCOR IDEA-France试制,将III期CRC病征随机分为3个月 vs 6个月的专用既有疗。在对直接参与III期试制的III期CRC病征展开的首次ctDNA-MRD评量之中,有13.8%的病征术后为ctDNA-MRD阴性,并被确认为独立的病因标志物。3 同时,学术科学界也指显露,与其他引入NGS步骤的ctDNA-MRD学术研究相比,本学术研究之中ctDNA的阴性率较高。清晰度和PPV同样低于NGS验证结果,ctDNA-MRD阴性和阴性的5年DFS分别为65%和73%,尽管专用病人的和不全然的前分析方法样本处理方式显然不会对这些结果产生制约。该步骤在在的是其相对简单,相当常低的成本和潜在的带入性,不需商业验证之中所见的专利验证步骤。正试图展开的创新性学术研究将促使评量相当常少尿液ctDNA验证是否是能够有效评量MRD,以便对CRC病征展开风险分层,并指导工作专用病人决断。

无论引入何种步骤,相当常少用尿液ctDNA-MRD验证来指导工作CRC病征的病人立即,需有效且有效的验证步骤。需促使进一步提高相当常少尿液ctDNA-MRD验证的清晰度来具体哪些病征可以从病人再降之中单单,以避免不恰当地选择高危病征遵从较高强度的病人。Parikh及其上司的学术研究结果表明,结合遗传物质组和表观遗传物质组以及纵向尿液监控,可相当大进一步提高相当常少尿液ctDNA-MRD的清晰度。相比之下,ctDNA-MRD验证的高基因表达对于ctDNA作为一个清晰的生物标志物来具体病人升级是至关重要的。由于基因表达太少,;也阴性的ctDNA-MRD显然不会使病征遵从不必要的强既有病人。Parikh及其上司的学术研究结果显然,除体系性状外,还可以通过联结表观遗传物质组性状构造的分析方法来保持一致基因表达。Taieb等人的分析方法步骤的优势在于进一步提高了诊疗构造的清晰度和病因,但是,正如学术科学界承认的那样,单独的两个遗传物质性状标记显然无法获取与联结体系性状步骤的有效性构造。重要的是,这项工作也突显了通用分析方法前条件的重要性,因为各种提取步骤可以在很大以往上制约ctDNA的得率和清晰性。在并未来的学术研究之中,这些分析方法前的考虑将更为更加重要。

性状被划定MRD验证的发展前景是恰当的,希望这些进展将一直进一步提高下一代MRD验证的有效性。总之,相当常少尿液ctDNA-MRD的验证获取了一个独特的机不会,运用于一种无创步骤来探索病人提案,并有显然根除高危病征的微集中于性病灶。这些学术研究结果无论如何为并未来ctDNA-MRD指导工作的创新性诊疗试制铺平了沿路。

MRD,始终是一个较慢发展的领域,我们预计近两年显然不会显露现一新确实,要么显示显露MRD验证的诊疗效用的局限性,要么显示显露MRD验证的其他优势和新功用。

参考文献:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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