顺应潮流：仅血液ctDNA-MRD检测的应用前景！

"底物被划入MRD测定的潜力是明确的，愿意这些十分困难将继续减低下一代MRD测定的稳定功能性。"

乳癌的MRD测定是一种灵敏且特异的可用风险分析报告乳癌病人人体内当中源功能性遗传物质（如ctDNA）比较为数的方式。在这种状态下，病人没有肉眼可见的病变，但确实长期存在基准流行病学摄影机方式无法测定到但最后不会引致乳癌患上的或多或少病变。

MRD，常称为或多或少湿气病变（Minimal Residual Disease）。适用“Minimal” （或多或少）这个名词，是因为它在历史文献和流行病学技术人员当中越来越常用。不过，“Minimal”这个名词显然带有“误导功能性”，因为低低水平的病变在低血压和则有科手术对政府方面也显然带有不可忽视意义。“Measurable”（可测量）一名词可越来越直观地详细描述湿气在病人人体内的免疫细胞的长期存在。NCCN简要同时适用了“Minimal Residual Disease”（或多或少湿气病变）和“Measurable Residual Disease”（可测量湿气病变）两个专有名词。

此则有，可行功能性分析暗示在分子低水平上测定多种乳癌类型的ctDNA某种程度带有流行病学效用，历史文献和流行病学技术人员有时也不会适用“Molecular Residual Disease”（分子湿气病变）一名词。

近来，国内则有在本体当中基于ctDNA的MRD分析报告（ctDNA-MRD）的流行病学数据库和结论越来越多，开启了本体疣MRD测定的狂潮。本体疣ctDNA-MRD测定的电子技术学派主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（不知情比对）

对原发该构成员织进行时PCR以鉴定病人的特异遗传构成员变异图谱，然后最初设计引物定制panel或适用固定panel进行时个功能性化的ctDNA测定比对。

2）Tumor-uninformed assays（并不知道比对）

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即不须原发该构成员织，均依赖于构成员合成预先物色引物/探针最初设计的与乳癌类型相关的固定panel进行时ctDNA测定比对，常在测定ctDNA特异功能性的同时，都以ctDNA底物或相片构成员学等除此以外成员学方式。毕竟了该构成员织样品缺乏或风险分析报告位点缺乏或TAT过长等原因。

Tumor-informed assays的电子技术意图越来越合乎大众的认知，在之前减低免疫的之也就是说下，可通过风险分析报告多位点的sample-level（样品低水平）再进一步减低其精确度，电子技术最低基准比较来说不是之外低。Tumor-uninformed assays的电子技术意图越来越相似早筛，通过减低site-level（位点低水平）测定精确度并都以ctDNA底物或相片构成员学并建构建模算法再进一步减低其精确度和免疫，电子技术最低基准比较来说很低。

2021年4月29日，《Clinical Cancer Research》在线发表了“均适用血红素ctDNA测定娆膀胱癌病人或多或少湿气病变（MRD）”的文章，首次公开了Guardant Reveal的分析数据库：MRD测定精确度远超到91%，免疫远超100%，这些注意到支持了均血红素ctDNA-MRD测定（Tumor-uninformed assays）的潜在流行病学运可用。

2021年8月13日，《Clinical Cancer Research》在线发表了“顺应潮流：均血红素ctDNA-MRD测定的运可用之前景”的文章，在这里分析者们争辩分析报告了均血红素ctDNA测定MRD的技能，以及将底物拆分到ctDNA测定的潜在好处。2

Parikh及其合作者1 和Taieb及其合作者3 争辩了均血红素ctDNA-MRD测定在娆膀胱癌（CRC）病人当中的潜在流行病学运可用。

▲ ctDNA底物和特异功能性在两项分析当中的运可用比较（Parikh和Taieb）

娆膀胱癌（CRC）的则有科手术仍然接踵而来着一个挑战，即相当多的CRC病人因越来越早功能性疾病患上而以致于死亡。尽管流行病学采用了基准的专用则有科手术，但低风险IIIC期CRC病人的5年成功率也均有53%，话虽如此是没有注意到检查和上不曾测定到的或多或少湿气病变（MRD）。4

目之前，仍有鉴于此直观已确定哪些病人术后长期存在MRD，以为了让个人兴趣减低或减少专用则有科手术，并减少治愈的先之前，同时尽量减少地减低显然会则有科手术的相关毒功能性。

在过去的几年里，我们对ctDNA在CRC诊断和低血压当中的运可用有了相当多的了解。目之前，基于ctDNA的MRD分析报告恰巧相当多运可用于乳癌的则有科手术当中。

ctDNA是由DNA的短相片构成员成（大约130-150bp），由免疫细胞通过突变、坏死或分泌释放到消化道当中。 ctDNA的同位素较短情况严重其成为敏感的实时负荷圣万，它的长期存在显然体现了检查和上看见的旋转移。

在治愈功能性则有科手术终娆后，ctDNA当中出现的体细胞特异功能性对随后的检查和患上带有很低的HIV预期价值，之外是当这些特异功能性与截肢的该构成员织当中的特异功能性相匹配时。测定这种ctDNA假定的MRD可以在I-III期CRC当中提之前检查和数月预期患上，从而为构成员合成最后不会患上的CRC病人给予一个分析报告最初疗法的视窗。然而，这些ctDNA经济制度特异功能性假定的MRD测定方式的精确度仍然是受限的，有鉴于此改进其测定稳定功能性。

ctDNA的底物测定比不上ctDNA的经济制度特异功能性测定。ctDNA的底物异常在CRC当中非常常见于，并被认作大多数癌变的越来越早阶段。这种底物，完全一致假定为DNA当中嘧啶的C5位置去掉甲基基团，通气邻近遗传的表远超出来，还包括经典的抑癌遗传失活。与经济制度特异功能性相比，CRC当中长期存在越来越多的底物异常范围，为减低MRD测定的精确度给予了机不会。SEPT9，就是第一个并用人体内测定单遗传底物异常进行时化疗和越来越早测定CRC的方式。尽管ctDNA底物有这些优点，但这些相近的特功能性也必需慎重，以保持测定比对的免疫，并尽量减低；也HIV的先之前。

在这种背景下，Parikh和Taieb的总括最最初分析娆果为我们对ctDNA稳定功能性的理解给予了有用的补充，即不须原发该构成员织，均通过人体内ctDNA底物或联合ctDNA特异功能性即可进行时直观的MRD分析报告。与其他必需对原发该构成员织进行时PCR以个人兴趣后续ctDNA比对的测定不同，总括分析探讨了Tumor-uninformed assays的有效功能性，它有几个劣势，还包括加速的TAT，减低初始成本，对该构成员织缺乏或不可用的病人进行时风险分析报告。

Parikh等人给予了一种ctDNA底物建构ctDNA经济制度特异功能性的固定panel进行时MRD的比对分析报告（NGS方式），与其他零售上可用的MRD测定方式相比，这种方式不必需截肢的该构成员织以及定制化。在最后则有科手术后适用时，这种均血红素ctDNA-MRD测定对患上带有流行病学意义的免疫（100%）和精确度（55.6%），通过拆分微小遗传构成员特功能性和平行风险分析报告比对，其精确度可再进一步减低至91%。1 该方式被可用恰巧在进行时的实用功能性分析，还包括个人兴趣IIA期患上则有科手术对政府的NRG合作构成员分析（NCT04068103）。虽然还必需额则有的数据库集来的测试这些注意到，但这些娆果说明了基于ctDNA的MRD测定在并不知道的意味着可接受的测定稳定功能性特功能性。

Taieb等人的分析并用了一对先之前被证明是CRC截肢后低血压相关的底物遗传标记物WIF1和NPY（ddPCR方式），并将它们运可用于PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验车，将III期CRC病人随机分为3个月 vs 6个月的专用化疗。在对参与III期试验车的III期CRC病人进行时的首次ctDNA-MRD分析报告当中，有13.8%的病人术后为ctDNA-MRDHIV，并被确认为独立的低血压圣万。3 同时，分析者也指出，与其他采用NGS方式的ctDNA-MRD分析相比，本分析当中ctDNA的HIV率较低。精确度和PPV某种程度低于NGS测定娆果，ctDNA-MRDHIV和阴功能性的5年DFS共五65%和73%，尽管专用则有科手术的和不理想的之前比对样品处理显然不会对这些娆果造成影响。该方式值得注意的是其比较最简单，非常低的成本和潜在的重演功能性，不必需零售测定当中所见的专利测定方式。恰巧在进行时的实用功能性分析将再进一步分析报告均血红素ctDNA测定是否必须直观分析报告MRD，以便对CRC病人进行时风险各别，并个人兴趣专用则有科手术对政府。

无论采用何种方式，均用血红素ctDNA-MRD测定来个人兴趣CRC病人的则有科手术最终，必需精确且直观的测定方式。需再进一步减低均血红素ctDNA-MRD测定的精确度来已确定哪些病人可以从则有科手术降级当中获益，以避免不恰当地选项低危病人接受较低强度的则有科手术。Parikh及其合作者的分析娆果暗示，拆分遗传构成员和微小遗传构成员以及平行血红素风险分析报告，可显著减低均血红素ctDNA-MRD的精确度。相比之下，ctDNA-MRD测定的低免疫对于ctDNA作为一个比较最简单的生物圣万来已确定则有科手术升级是至关不可忽视的。由于免疫缺乏，；也HIV的ctDNA-MRD显然不会使病人接受显然会的大幅减低则有科手术。Parikh及其合作者的分析娆果证明，除经济制度特异功能性则有，还可以通过建构微小遗传构成员底物特功能性的比对来保持免疫。Taieb等人的比对方式的劣势在于减低了流行病学特功能性的精确度和低血压，但是，恰巧如分析者承认的那样，基本上的两个遗传底物标记显然无法给予与建构经济制度特异功能性方式的稳定功能性特功能性。不可忽视的是，这项文书工作也强调了简化比对之前条件的不可忽视功能性，因为各种所含方式可以在太大往往上影响ctDNA的得率和比较最简单功能性。在将来的分析当中，这些比对之前的考虑将变得越来越不可忽视。

底物被划入MRD测定的潜力是明确的，愿意这些十分困难将继续减低下一代MRD测定的稳定功能性。总之，均血红素ctDNA-MRD的测定给予了一个最初颖的机不会，适用一种无创方式来探索则有科手术提案，并显然会根除低危病人的旋转移功能性病变。这些分析娆果或许为将来ctDNA-MRD个人兴趣的实用功能性流行病学试验车铺平了道路。

MRD，仍然是一个加速拓展的领域，我们预计近两年显然不会出现最初的结论，要么推测出MRD测定的流行病学效用的局限功能性，要么推测出MRD测定的其他劣势和最初用途。

参考资料：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.